4 Fragen zu Alanin

Ein Tripeptid besteht aus drei Aminosäuren, die durch Peptidbindungen miteinander verbunden sind. Wenn wir L-Alanin (Ala) und L-Serin (Ser) betrachten, können die möglichen Tripeptide in verschiedenen Kombinationen gebildet werden. Die möglichen Tripeptide sind: 1. Ala-Ala-Ala 2. Ala-Ala-Ser3. Ala-Ser-Ala 4. Ala-Ser-Ser 5. Ser-Ala-Ala 6. Ser-Ala-Ser 7. Ser-Ser-Ala 8. Ser-Ser-Ser Das ergibt insgesamt 8 verschiedene Tripeptide, die aus L-Alanin und L-Serin gebildet werden können.

Die Seitenkette von Alanin (eine der 20 proteinogenen Aminosäuren) ist eine Methylgruppe (-CH₃). Diese Seitenkette ist unpolar und trägt keine Ladung.

Das Dipeptid von Alanin und Glycin, auch als Alanylglycin bezeichnet, besteht aus den Aminosäurenin und Glycin, die durch eine Peptidbindung verbunden sind. Im basischen Milieu reagiert das Dipeptid folgendermaßen: 1. **Deprotonierung der Aminogruppe**: Die freie Aminogruppe am N-Terminus des Dipeptids wird deprotoniert, da basische Bedingungen (hoher pH-Wert) Protonen (H⁺) entfernen. Dies führt dazu, dass die Aminogruppe eine negative Ladung annimmt. 2. **Deprotonierung der Carboxylgruppe**: Die Carboxylgruppe am C-Terminus des Dipeptids wird ebenfalls deprotoniert, was zu einer negativen Ladung an dieser Stelle führt. 3. **Stabilität der Peptidbindung**: Die Peptidbindung selbst bleibt in der Regel stabil und wird nicht durch basische Bedingungen gespalten. Zusammengefasst führt die basische Umgebung dazu, dass die Amino- und Carboxylgruppen des Dipeptids deprotoniert werden, was zu einer negativen Ladung an beiden Enden des Moleküls führt.

In Organismus B, der einen GC-Gehalt von 35 % hat, ist der AT-Gehalt entsprechend höher (65 %). Da die Codons für Phenylalanin (UUU und UUC) Uracil (U) enthalten, ist es wahrscheinlicher, dass das Codon UUU häufiger vorkommt, weil es ausschließlich aus Uracil besteht und somit besser zu einem Organismus mit hohem AT-Gehalt passt.